氧化型殺菌滅藻劑是具有氧化性質的殺生藥劑，是強氧化劑，在微生物體內的酶能被氧化而使微生物被殺滅。循環水中所用的氧化性殺菌劑最常使用的是氯及其化合物。在循環水中最常使用的只是氯及其化合物，近年來溴化物已用于循環水系統中，其發展也越來越受重視。
一般認為，在水中起殺菌作用的是HClO或HBrO，電離的程度取決于pH值，pH值為6.5-9.0范圍內HClO發生強烈電離。當pH值＜6.5時，游離氯幾乎完全以次氯酸的形式存在，而當pH值＞9.0時，游離氯余氯大部分以次氯酸根形式存在，次氯酸含量很少。HBrO也隨pH值的升高而離解，但離解同樣摩爾分數時，HBrO的pH值要高些。由此可見，pH值在酸性時氯的殺生效果較好，pH值升高時效果下降，氯耗增加。若使用溴殺生，酸性堿性殺生效果都好。所以在堿性條件下，溴殺生比氯有利。
從環保的角度來看，溴的衰減速度快，排放后無污染。而環保對于余氯量有嚴格要求。但由于溴使用不便和價格原因，未普遍使用于循環水中。
常用的次氯酸鹽有次氯酸鈉，次氯酸鈣及漂白粉。次氯酸鹽近年來用于循環冷卻水中，當循環水中次氯的濃度較高時，對系統有剝離作用，可以處理設備上沉積的黏泥。
循環水質為結垢型時，為避免結鈣垢，一般選用次氯酸鈉。水中含鈣量少的腐蝕型水則選用次氯酸鈣或漂白粉。次氯酸鹽價格便宜，來源方便，運輸和使用都比較安全。但貯存期不易長，以防分解失效。
